La sección Registro y Control de Procedimientos, Documentos e Información comprende las subsecciones:
-Registro General
-Registros
-Gestión de la Documentación Administrativa
-Certificaciones
-Gestión de los Sistemas de Información y Nuevas Tecnologías
La sección Protección de la salud pública y control sanitario comprende las subsecciones:
-Bienestar Animal
-Control de Plagas Urbanas
-Enterramientos y gestión del cementerio de Mazarrón
-Enterramientos y gestión del cementerio de Puerto de Mazarrón
-Suministros básicos
-Gestión de residuos
-Control Sanitario
Documentación inactiva y cerrada por extinguirse la obligatoriedad del Servicio Militar en 2001. La sección Atenciones Militares comprende las subsecciones:
-Expedientes generales e individuales
-Revistas anual y de comisario
-Requisición militar
-Suministros y bagajes, salarios
-Correspondencia
-Varios
Comunicación e información.
La sección Gestión del Patrimonio y Bienes Municipales comprende las subsecciones:
-Inventario General de Bienes
-Adquisición de Bienes
-Enajenación de Bienes
-Autorizaciones y Concesiones de Uso de bienes
-Arrendamiento de Bienes
-Investigación de Bienes
-Deslinde de Bienes
-Recuperación de Oficio
-Desahucio Administrativo
-Sanciones
-Alteración Fincas Colindantes
-Expedientes de Reclamación por Daños a Bienes Municipales
-Expedientes de Responsabilidad Patrimonial
-Expedientes de Gastos del Patrimonio Municipal
La sección Administración de los Recursos Económicos comprende las subsecciones:
-Gestión Presupuestaria y Contabilidad Administrativa
-Control y Fiscalización
-Tesorería
-Recaudación
-Gestión Tributaria
-Subvenciones
-Rentas Provinciales
La sección Fijación del Término Municipal comprende las subsecciones:
-Fijación del Término Municipal
-Callejero
La sección Planeamiento comprende la subsección Planeamiento.
La sección Organización y gestión de las fiestas populares y actos públicos comprende la subsección Organización y gestión de las fiestas populares